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まず、「予習」をしておきます。 ※ とりあえず、飛ばし読みしてOKです。
なお、HLA に関しては、今回初めて学習しました。したがって、コピペを貼りまくりたい気分だけど、それだとみなさんが理解しにくいので、知ったかぶりして、わかりやすく説明する「努力」はしています。ただ、よく理解できていない部分については、コピペしてます。なお、実際のHLA の標本数の問題からか、データの数字は、論文によって少しバラつきがあるので、アバウトな平均値で記述しています。
HLA とは…HLA（Human Leukocyte Antigen＝ヒト白血球抗原）は、赤血球を除くほぼ全ての細胞と体液に分布しする、自然免疫の基本型です。
もともと、白血球の血液型として発見されたので、名前の一部に「白血球」という言葉が残っています。HLAは、A座、B座、C座、DR座、DQ座、DP座など多くの抗原の
組み合わせで構成され、それにさらにそれぞれが数十種類の異なるアレルをもち、ハプロタイプ（父母それぞれから受け継いだ遺伝子座の一対）の組み合わせは数万通りともいわれます。
座位 （locus） ・・・ 相同染色体上の遺伝子がある場所のこと。種において安定な単位。
アレル （allele） ・・・ 相同染色体上の対になっている遺伝子同士。
・・・なんだけど、「型」だと理解した方がわかりやすい。
ハプロタイプ ・・・ （haplotype） アレルの組合せ。
ディプロタイプ ・・・ （diplotype） ハプロタイプの組合せ。
遺伝型 (genotype) ・・・ ある座位のアレルの組合せ。個体において安定な単位。
なお、日本人の持つアレルの頻度の一覧表は、これを見ればわかります。
ＨＬＡアレル一覧表（JSHI）2019年度版 ************************************************************************
私が HLA に注目したのは、論文のこの部分にヒントを得たからです。
HLA allelic incidence in the population. We identify HLA-B*46:01 as the HLA allele with the fewest predicted binding peptides for SARS-CoV-2. We performed the same analyses for the closely-related SARS-CoV proteome and similarly note that HLA-B*46:01 was predicted to present the fewest SARS-CoV peptides, in keeping with previous clinical data associating this allele with severe disease.
そして、調べた結果、以下の知見を得ました。
2003年に流行したSARS（SARS-CoV）では、日本人の感染者はゼロであった。人種による偏りが大きいことに気づいた台湾の研究チームが調査した結果、
SARS（SARS-CoV）は、
HLA型がHLA-B46、HLA-B54（中国南部、香港、台湾に多い）
の人に感染し、HLA-B46の人のみ重症化させることが判明した。え～と、前回の復習をしておきます。
この表の「SARS-CoV」がSARSで（上から２番目）、「SARS-CoV-2」が新型コロナです（一番上）。
この２つのゲノム配列は、ほぼ同じと言えます（青い部分）。
特に、抗原（免疫）に関連するゲノム配列（赤い部分）は、100％一致しています。
以上のことを考え合わせると、
新型コロナウイルス感染症で重症化する可能性が最も高いのは、HLA-B４６型の人である、と言えます。
※ このことは、「HLA-４６型の人は必ず重症化する」ことを意味しませんし、、「HLA-B４６型の人以外は絶対に重症化しない」ことも意味しません。
その他、この論文から読み取れること、この論文を手掛かりに調べてわかったことを列挙していきます。
◎ HLA-B４６型 の分布地図
上図は、国別のHLA-B４６型の分布図です。色が濃い国ほど、
B４６型の人がいる割合が高い国です。
最も色が濃いのは
中国です。あと、東南アジア。
（ロシア・アメリカ・日本・ドイツにも、黄色が塗られています。）
つまり、今回の新型コロナウイルス感染症は、世界で最も重症化しやすい地域で始まったから、大問題に発展したとも言えます。
このB４６型の遺伝子が、歴史的にどう伝搬したかもわかってます（
緑色の矢印）。
発生は中国の南方のようです。
緑色の矢印の元をたどると、まさに武漢市。
ここまで条件がそろうと、今回の問題は、起こるべくして起こったとしか、言いようがないです。SARSウイルス８SARS-CoV）にしろ、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）にしろ、中国だからこそ、増殖できたのではないでしょうか。
「中国が武漢市の研究所で生物兵器としてのウイルス開発していた」みたいな陰謀論を耳にすることがあります。もし、本当なら、中国は、自国民に最も危険な生物兵器を開発していたことになります。
ありえないですよね。
この陰謀論はさすがにあり得ませんが、逆にSARSの経験から、自国防衛のためにSARSを研究していて、たまたまSARSの変異体ができちゃった、みたいなことはあるのかな～ ?
◎ その他のアレルこの論文では、新型コロナウイルスに対して、最強の免疫力を発揮するアレルや、ほぼ免疫力がゼロに等しいアレルを教えてくれています。
これらのアレルを、紹介していきます。
※ 論文中の「Figure 1」の上部
① A２型
最上位に君臨する最強のアレルが、A２型のアレルです。
このアレルを持つ人は、新型コロナウイルスが侵入しても、一気に殲滅できます。したがって、増殖すら許さないので、自分が発症しないばかりか、他人に感染させることもありません。
日本人の約２５％が、この最強アレルを持っていることがわかっています。
ちなみに、中国・南ヨーロッパ（スペイン・イタリア）などの国は、このＡ２型が少ないです。これらの国で感染率や重症化率が高いのは、この最強アレルを持つ人の割合が低いからです。日本・インド・アルゼンチンといった国々で感染率や重症化率が低いのは、この最強アレルを持つ人の割合が高いからです。
決して、ハグをするとかしないとか、衛生観念が高いとか低いとか、マスクの着用率が高いとか低いとか、そういう迷信めいた考え方から早く脱却して欲しいです。
② B１５型
Ｂ座の中の最強アレルが、Ｂ１５型です。
日本人の約１０％が、このアレルを持っています。
③ Cw１２型
Ｃ座で最強のアレルが、Cw１２型のアレルです。
日本人の１１％が、、このアレルを持っています。
Ａ座でA２型、Ｂ座でＢ１５型、Ｃ座でCw１２型のアレルを持つ人は、新型コロナに関しては、無敵状態です。絶対に発症しないでしょうね。
ただ、この最強トリオのハプロタイプ（アレルの組み合わせ）を持つ日本人がどのくらいいるのかは、調べてもわかりませんでした。
次に、最弱のアレルを見ていきます。
※ 論文中の「Figure 1」の下部
① A２５型
Ａ座の中の最弱アレルが、Ａ２５型です。
幸い、このアレルを持つ日本人の割合は、０．００２％と、ほぼいません。
② B４６型
Ｂ座の中の最弱アレル、というより、全アレル中で最弱なアレルが、すでに紹介したＢ４６型です。
日本人の４～５％が、このアレルを持っています。
なお、この図の中には明示されていませんが、
B５４型 のアレルを持つ人は、新型コロナウイルス感染症を発症しやすいです。ただ、重症化には至りません。日本人の７～８％の人が、このアレルを持っているようです。このアレルを持つ人は、糖尿病になりやすいということがわかっています。
③ Cw１型
Ｃ座の中の最弱アレルが、Cw１型です。
日本人の１７～１８％が、このアレルを持っています。
なお、今までアレル単体で説明してきましたが、
実際の免疫力は、アレルの組み合わせであるハプロタイプで判断しなければなりません。例えば、日本人の中で最も多いハプロタイプは、
A＊24:02-C＊12:02-B＊52:01-DRB1＊15:02-DQB1＊06:01-DPB1＊09:01
で、「A２４型-Cw１２型-B５２型」です。
日本人の７％が、このハプロタイプです。
この場合、Cw１２型の強いアレルを持っているので、発症しません。
したがって、重症化を招くＢ４６型のアレルを持っている人でも、Ａ座でＡ２型のアレルを持っていれば、Ａ２型のアレルが活躍するので、重症化はおろか、発症すらしないでしょう。
実際、Ｂ４６型のアレルを持つ日本人のハプロタイプを調べると、多い順に
A＊02:07-C＊01:02-B＊46:01-DRB1＊08:03-DQB1＊06:01-DPB1＊05:01
A＊02:07-C＊01:02-B＊46:01-DRB1＊08:03-DQB1＊06:01-DPB1＊02:02
となっており、ともに、「A２型-Cw１型-B４６型」 です。
Ｂ座・Ｃ座は、Cw１型、B４６型という最弱コンビですが、Ａ座にＡ２型の持つので、発症しません。
◎ 国によるハプロタイプの違 ＜ 地域・民族によるハプロタイプの違い現在、新型コロナ感染症対策は、国レベルでなされています。そして、各国を比較して、その政策の妥当性を議論しています。
しかし、それは、ハプロタイプが同じであるという幻想の元になされていおり、全く科学的ではありません。
実際、調べてみて驚いたが、すでにＨＬＡの科学的知見は、相当ﾊｲﾚﾍﾞﾙであり、かつ、詳細になされています。
なぜ、この科学的知見が政策に生かされていないのか、不思議でなりません。
最低限、国レベルではなく、民族別、地域別の政策がなされるべきだと思います。
例えば、日本では、各都道府県別に、ハプロタイプの出現率がわかっています。
であれば、各都道府県別に、ＨＬＡのハプロタイプを基準とした政策判断をするのは難しくないです。
日本骨髄バンク登録ドナーにおけるHLA遺伝子頻度・ハプロタイプ頻度（日本赤十字社）※ 「骨髄移植」と「感染症」は、免疫＝ＨＬＡ でつながっている。ただ、学者間で連携（協力関係）ができていないのでは、と勘ぐってしまいます。
◎ 糖尿病と香川県（余談）上述したように、Ｂ５４型のアレルは、新型コロナウイルす感染症に無力なアレルですが、糖尿病を誘導するアレルでもあります。
実は、このＢ５４型のアレルの出現率が最も高いのは、徳島県です。そして、その周辺地域である香川県、高知県、和歌山県が、糖尿病アレル王国を形成しています。
というわけで、香川県人に糖尿病が多いのは、遺伝的なものが主たる原因です。決してうどんだけのせいではないと思われます。
【こ】
※ Ｍｅｍｏ
この論文（研究）では、新型コロナウイルスがコードする１０種類のタンパク質からできると想定される４８,３９５種類のペプチドから、HLA-A,B,CそれぞれのMHCと結合して提示される可能性があるペプチドを３２,２５７種類選び出し、現在得られる１４５種類のHLAそれぞれとの結合性を計算している。
結果は、多種類のペプチドと結合できるHLAから、ほとんどコロナ由来ペプチドとは結合できないHLAまで極めて多様であることが明らかになった。
